setTimeout("関数名" , 3000);
<input type="button" id="settime" value="ここ押して3秒経つと表示されるよ!"></input>
<script type="text/javascript">
var setTime = document.getElementById('settime');
var hyoji = document.getElementById('koko');
function message(){
hyoji.innerHTML = "3秒経ったよ。";
}
setTime.onclick = function(){
setTimeout("message()" , 3000);
</script>